223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4104 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  100 
 
 
283 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  98.59 
 
 
283 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  39.33 
 
 
282 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  42.86 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  39.44 
 
 
291 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  41.67 
 
 
282 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  41.73 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  41.73 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  41.73 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  41.73 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  41.35 
 
 
282 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  41.35 
 
 
282 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  34.16 
 
 
284 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  34.66 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.85 
 
 
283 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  40.21 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.09 
 
 
292 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  29.21 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  27.12 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  26.3 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  41 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  25.26 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  23.61 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.69 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0471  ATP synthase F1, H+-transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.05 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0106314  normal  0.135636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.81 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  29.52 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  31.36 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  26.37 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  24.2 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.15 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  22.53 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  30.89 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  23.1 
 
 
297 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0844  ATP synthase F1, gamma subunit  25.09 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.27 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  24.51 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.21 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.66 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  23.51 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  20 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.18 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  24.5 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.18 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1180  ATP synthase F1, gamma subunit  24.76 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.30145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1274  ATP synthase F1, gamma subunit  24.76 
 
 
273 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.145072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  25.26 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.7 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl114  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.01 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.35 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  23.24 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.35 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.7 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.031727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.87 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  21.93 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.9 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.26 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.22 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.22 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
286 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.13 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  30.43 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.91 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.61 
 
 
294 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  22.3 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  22.76 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  28.38 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.88 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  24.75 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.24 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  24.39 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.85 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  22.92 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.36 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  23.18 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.21 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  24 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.82 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.38 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.03 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.88 
 
 
286 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  28.18 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  20.45 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.85 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.92 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.92 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.92 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.98 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4873  ATP synthase F1, gamma subunit  33.33 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>