35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0844 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0844  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
290 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2335  hypothetical protein  34.29 
 
 
289 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  34.06 
 
 
275 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.84 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.26 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  20.49 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  24.73 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  23.53 
 
 
283 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  23.38 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  24.26 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  20.65 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  24.55 
 
 
292 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.29 
 
 
290 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.65 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2047  hypothetical protein  52.11 
 
 
103 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.726464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1707  ATP synthase F1, gamma subunit  52.11 
 
 
103 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  24.88 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  24.88 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  24.88 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.57 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  24.26 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  24.26 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  24.26 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  24.12 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  23.33 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.76 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  25.42 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.03 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.33 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.62 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2997  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  21.91 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.03 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  21.63 
 
 
290 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.81 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  21.92 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>