169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1886 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  100 
 
 
284 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  71.99 
 
 
282 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  57.34 
 
 
282 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.23 
 
 
282 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.23 
 
 
282 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  56.23 
 
 
282 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.23 
 
 
282 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.23 
 
 
282 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.23 
 
 
282 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  54.65 
 
 
283 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  51.58 
 
 
291 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  52.67 
 
 
281 aa  255  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  54.09 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  41.55 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  34.04 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  34.74 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  28.92 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.82 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.93 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0471  ATP synthase F1, H+-transporting two-sector ATPase gamma subunit  25.26 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0106314  normal  0.135636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  25 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  24.83 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.83 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.78 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.78 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  28.67 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  23.58 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  26.1 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  27.09 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  27.27 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  27.15 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  24.58 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.04 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.14 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.04 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.04 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.98 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  35.29 
 
 
163 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.04 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  27.4 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  26.39 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.14 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  20.71 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0271  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.08 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  21.8 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.05 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  21.65 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.41 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.41 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.36 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.81 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  26.02 
 
 
365 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.81 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  26.04 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  25 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.84 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.91 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.67 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  26.03 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.11 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.4 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  20.76 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.56 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.33 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.33 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.58 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  25.08 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.37 
 
 
283 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.57 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.48 
 
 
290 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.91 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  27.72 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.26 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0862  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.04 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.337065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.71 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.82 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0746  ATP synthase F1, gamma subunit  20.56 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2607  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.19 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.89 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.33 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.79 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  46.38 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  21.62 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.48 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.48 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.97 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.7 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  25 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  21.77 
 
 
303 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.31 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.61 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.17 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.37 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1180  ATP synthase F1, gamma subunit  23.33 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.30145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.38 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.25 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.63 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>