More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1180 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1180  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.30145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1274  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.145072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0326  ATP synthase F1, gamma subunit  46.76 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0291  ATP synthase F1, gamma subunit  44.93 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0746  ATP synthase F1, gamma subunit  42.18 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  33.44 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  35.66 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  31.56 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.48 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.98 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.98 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  34.49 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.34 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.74 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.8 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.78 
 
 		 298 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  34.86 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.75 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  34.49 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.21 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  34.86 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.82 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.05 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.43 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  31.94 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.64 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  33.56 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.58 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.05 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.36 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  30.07 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.18 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 		 290 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.4 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  33.22 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  32.64 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.83 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.27 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.74 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.52 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.63 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.74 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  34.15 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  31.43 
 
 		 315 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.17 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.41 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.52 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.96 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.04 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.38 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.74 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.36 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  31.85 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  33.1 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  31.12 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.38 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.21 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.32 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.52 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.31 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  33.11 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.74 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  30.38 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.29 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.38 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  33.69 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  30.94 
 
 		 299 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.38 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.8 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.04 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.01 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.74 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.96 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  29.72 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.58 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.27 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.93 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.87 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.52 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  30.2 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>