More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0291 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0291  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
273 aa  553  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0326  ATP synthase F1, gamma subunit  57.82 
 
 
274 aa  334  9e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1180  ATP synthase F1, gamma subunit  44.93 
 
 
278 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.30145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1274  ATP synthase F1, gamma subunit  44.28 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.145072  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0746  ATP synthase F1, gamma subunit  42.09 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  34.14 
 
 
299 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.71 
 
 
289 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  37.41 
 
 
285 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.69 
 
 
298 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  35.25 
 
 
293 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
305 aa  148  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.27 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  37.13 
 
 
285 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl114  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
288 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
288 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.59 
 
 
291 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  33.33 
 
 
303 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.54 
 
 
302 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  30.1 
 
 
308 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  36.76 
 
 
285 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.86 
 
 
285 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
289 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
288 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.39 
 
 
291 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.18 
 
 
290 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.39 
 
 
291 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  32.53 
 
 
287 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.21 
 
 
281 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.11 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0083  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.86 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.14 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.83 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.98 
 
 
291 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.21 
 
 
289 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.85 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.25 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  29.67 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.14 
 
 
286 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  30.46 
 
 
311 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.98 
 
 
291 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.18 
 
 
295 aa  138  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.49 
 
 
283 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.95 
 
 
291 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.12 
 
 
297 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  30.53 
 
 
291 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  31.44 
 
 
306 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.87 
 
 
294 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  34.18 
 
 
291 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.87 
 
 
294 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  32.39 
 
 
306 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  32.87 
 
 
292 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.98 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  31.62 
 
 
289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.98 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.18 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.26 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.26 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.26 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 
283 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.26 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.26 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.26 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  31.51 
 
 
300 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  31.36 
 
 
298 aa  135  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.19 
 
 
315 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  30.71 
 
 
286 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.26 
 
 
291 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.53 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.28 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.28 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.68 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.71 
 
 
290 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.53 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.63 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.63 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.63 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.07 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  33.67 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.89 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  31.6 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  30.84 
 
 
309 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.9 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.9 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  29.8 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.9 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.86 
 
 
286 aa  131  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 
286 aa  132  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  29.27 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.66 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  31.36 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.89 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  30.07 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>