176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2786 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  99.65 
 
 
282 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
282 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  99.65 
 
 
282 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  98.94 
 
 
282 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  98.94 
 
 
282 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  98.94 
 
 
282 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  92.2 
 
 
282 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  55.91 
 
 
282 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  56.23 
 
 
284 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  48.84 
 
 
283 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  47.54 
 
 
281 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  44.29 
 
 
291 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  47.52 
 
 
293 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  40.28 
 
 
290 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  40.38 
 
 
283 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  39.77 
 
 
283 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  24.58 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  36.81 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.77 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  30.48 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.55 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  24.91 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.84 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  23.97 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.09 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.3 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  25 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.86 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  20.56 
 
 
292 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.38 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.62 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.62 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  26.03 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  23.15 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  26.71 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  26.62 
 
 
309 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.99 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.66 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.09 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.06 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.33 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.09 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.77 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  26.09 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  24.51 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.26 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.26 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.3 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.02 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  24.27 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  23.49 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.92 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.38 
 
 
286 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.02 
 
 
286 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.49 
 
 
286 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  23.88 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  23.63 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.66 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.23 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.26 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.41 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.02 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  24.32 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.71 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  24.73 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.55 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.66 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.58 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.71 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  22.95 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.74 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.19 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.19 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.84 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.66 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.66 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.89 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.19 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  27.5 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.05 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.58 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.54 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.13 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.33 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.71 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>