24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1707 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2047  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  203  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.726464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1707  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 103 aa  203  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  50.52 
 
 		 275 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2335  hypothetical protein  45.65 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0844  ATP synthase F1, gamma subunit  49.49 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.37 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  40.28 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  32.65 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  31.91 
 
 		 281 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.68 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  35.37 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  37.04 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  32.05 
 
 		 315 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  34.29 
 
 		 310 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2997  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  36 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  29.9 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0588  ATP synthase F1, gamma subunit  37.88 
 
 		 269 aa  42  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.118844  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  34.92 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  29.89 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  29.89 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  29.89 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  29.89 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  29.89 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  29.89 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>