55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4380 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  55.81 
 
 		 183 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  46.2 
 
 		 172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  48.59 
 
 		 195 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  42.86 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  46.55 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  47.27 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  46.59 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  42.94 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  45.91 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  44.02 
 
 		 205 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  47.93 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  45.28 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  41.86 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  44.25 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  43.85 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  43.85 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  42.6 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  43.78 
 
 		 212 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  43.78 
 
 		 212 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  42.42 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  39.88 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  41.82 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  45.09 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  43.53 
 
 		 220 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  40.96 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  41.57 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  41.21 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  41.21 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  41.42 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  41.18 
 
 		 220 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  40.49 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  40.49 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  41.57 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  41.14 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  45.53 
 
 		 144 aa  104  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  36.69 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.07 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  34.55 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  31.09 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  30 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  41.25 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  31.19 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  31.86 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  30.28 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  30.69 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  32.58 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  29.36 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  35.48 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  30.69 
 
 		 345 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  33.65 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  34.74 
 
 		 226 aa  40.8  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>