34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2745 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  43.63 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  43.14 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  46.12 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  46.12 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  45.15 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  46.35 
 
 		 345 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  46.35 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  45.24 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  40.84 
 
 		 236 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  35.29 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  39.27 
 
 		 226 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  51.64 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  40.7 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  37.57 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  30.66 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  30.52 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  34.29 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  36.15 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  33.01 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  32.63 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  31.07 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  30.22 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  35.48 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  34.62 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  30 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  32.08 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  32.08 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  33.98 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  34.43 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  35.48 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  35.09 
 
 		 181 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  29.15 
 
 		 195 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>