35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6090 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  100 
 
 
217 aa  416  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  89.4 
 
 
214 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  88.02 
 
 
214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  90.78 
 
 
345 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  90.78 
 
 
217 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  68.22 
 
 
224 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  67.76 
 
 
224 aa  288  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  70.28 
 
 
218 aa  246  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  50.26 
 
 
236 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  45.24 
 
 
219 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  41.54 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  37.33 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  47.46 
 
 
232 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  45.24 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  28.04 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  28.04 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  33.68 
 
 
214 aa  89  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  30.71 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  35.71 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  32.77 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  33.72 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  31.48 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  33.72 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  29.92 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  29.17 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  32.67 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  28.48 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  25.69 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  30.39 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  27.74 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  27.74 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  29.03 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  26.88 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>