38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0433 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  71.83 
 
 		 224 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  71.29 
 
 		 224 aa  300  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  70.28 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  69.46 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  68.47 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  70.47 
 
 		 345 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  70.47 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  51.24 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  46.12 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  44 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  50.39 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  32.54 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  30.61 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  30.61 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  33.81 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  34.33 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  34.43 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  33.9 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  35.34 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  30.23 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  33.91 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  33.61 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  31.52 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  33.04 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  32.29 
 
 		 181 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  33.98 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  30.21 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  32.66 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  32.66 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  32.99 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  29.81 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  31.07 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  30.19 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  32.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  26.32 
 
 		 144 aa  42.4  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  29.13 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>