21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03736 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1992  ketosynthase  61.61 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2069  hypothetical protein  61.14 
 
 		 246 aa  211  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  36.42 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  35.34 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  33.07 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  30.53 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  31.58 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  35.71 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  31.62 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  29.32 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  29.77 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  29.13 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  28.21 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  30 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  26.49 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  26.49 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  32.43 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  25.68 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>