29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1378 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  38 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  37 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  39.55 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  43.4 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  42.77 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  39.27 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  44.44 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  45.7 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  43.28 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  43.28 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  34.47 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  34.47 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  37.44 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  43.9 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  34.27 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  33.93 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  29.15 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  35.07 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  34.04 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  32.43 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  34.55 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  35.11 
 
 		 212 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  35.11 
 
 		 212 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  37.86 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  34.74 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>