23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0803 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  99.57 
 
 		 246 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  34.47 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  30.66 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  32.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  27.35 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  37.1 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  25.23 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  28.05 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  34.68 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  34.68 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  34.68 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  33.87 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  34.68 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  30.65 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  33.33 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  26.55 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  27.87 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  31.15 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  31.78 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  40 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  32 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  34.88 
 
 		 186 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>