50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004066 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  53.8 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  47.03 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  43.01 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  44.92 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  45.16 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  45.99 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  43.85 
 
 		 182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  43.55 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  43.55 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  44.86 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  43.55 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  43.55 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  46.24 
 
 		 182 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  46.24 
 
 		 182 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  43.01 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  41.71 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  46.29 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  41.71 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  45.45 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  41.34 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  41.57 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  53.45 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  44.24 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  42.42 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  44.38 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  36.72 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  36.72 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  55.24 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  47.62 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  35.16 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  42.45 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  42.45 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  45.79 
 
 		 144 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  44.21 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  45.1 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  44.12 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  42.19 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.27 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  27.05 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  51.16 
 
 		 44 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  29.47 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  29.59 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  27.68 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  29.47 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  29.9 
 
 		 224 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  29.59 
 
 		 218 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  30.93 
 
 		 224 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>