46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0970 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.89 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  36.9 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  36.11 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  36.21 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  37.72 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  37.28 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  37.72 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  37.72 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  36.21 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  37.13 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  43.97 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  42.34 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  35.88 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  37.66 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  36.87 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  34.08 
 
 		 212 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  34.08 
 
 		 212 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  41.38 
 
 		 182 aa  97.8  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  47.62 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  41.13 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  41.75 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  40.57 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  36.22 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  42 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  35.75 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  35.75 
 
 		 213 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  39.62 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  33.71 
 
 		 205 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  35.37 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  40.2 
 
 		 220 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  36.25 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  41.51 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  38.24 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  41.51 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  28.89 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  31.76 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  28.24 
 
 		 232 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  30.59 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  32.46 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  43.9 
 
 		 44 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>