43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0892 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  100 
 
 		 185 aa  357  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  47.03 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  44.81 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  50.85 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  46.89 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  40.64 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  46.37 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  45 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  44.07 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  47.16 
 
 		 194 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  49.11 
 
 		 193 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  43.89 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  43.33 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  43.89 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  44.32 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  43.5 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  43.5 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  58.42 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  44.32 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  41.9 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  42.62 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  53.21 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  56 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  55 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  44.17 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  36.31 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  39.18 
 
 		 213 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  48.11 
 
 		 212 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  48.11 
 
 		 212 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  39.05 
 
 		 213 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  46.4 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  44.83 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  45.65 
 
 		 234 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  42.02 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  39.52 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.12 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  31.17 
 
 		 232 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  31.58 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  30.77 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>