41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0348 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  99.45 
 
 
182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  98.9 
 
 
182 aa  353  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  98.35 
 
 
182 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  92.86 
 
 
182 aa  333  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  91.21 
 
 
182 aa  328  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  91.21 
 
 
182 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  90.66 
 
 
182 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  75.28 
 
 
186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  73.08 
 
 
182 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  74.73 
 
 
182 aa  271  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  74.18 
 
 
182 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  70.17 
 
 
183 aa  259  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  69.06 
 
 
182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  88.24 
 
 
127 aa  185  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  42.86 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  45 
 
 
185 aa  141  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  43.55 
 
 
186 aa  140  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  44.69 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  42.22 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  48.51 
 
 
193 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  57.29 
 
 
183 aa  121  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  39.51 
 
 
172 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  42.17 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  38.51 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  36.87 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  37.29 
 
 
181 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  37.71 
 
 
213 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  37.71 
 
 
213 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  41.72 
 
 
181 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  37.93 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  45.92 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  44.9 
 
 
212 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  44.9 
 
 
212 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  45.83 
 
 
234 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  97.73 
 
 
44 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  35.23 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  36.72 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.67 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>