42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3513 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  360  9e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  76.88 
 
 		 186 aa  288  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  76.92 
 
 		 182 aa  288  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  74.18 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  73.63 
 
 		 182 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  73.63 
 
 		 182 aa  277  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  73.08 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  76.92 
 
 		 182 aa  275  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  71.43 
 
 		 182 aa  271  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  71.43 
 
 		 182 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  70.33 
 
 		 182 aa  251  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  69.61 
 
 		 183 aa  250  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  69.78 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  66.29 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  50.86 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  68.07 
 
 		 127 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  39.67 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  43.32 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  52.42 
 
 		 193 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  37.99 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  46.99 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  40.96 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  56.25 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  42.35 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  37.43 
 
 		 213 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  37.43 
 
 		 213 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  46.22 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  45.13 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  46.94 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  51.52 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  47.96 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  44.54 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  47.96 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  41.25 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  35.88 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.67 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  35.88 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  79.55 
 
 		 44 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  27.67 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>