25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0339 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  97.73 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  97.73 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  97.73 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  97.73 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  97.73 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  97.73 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  97.73 
 
 		 182 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 44 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  95.45 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  79.55 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  77.27 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  75 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  79.07 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  72.09 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  70.45 
 
 		 182 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  59.46 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  57.89 
 
 		 213 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  57.89 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  45.45 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  55.26 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  45.45 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  51.16 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  58.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  47.37 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>