42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4598 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  86.02 
 
 		 182 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  74.19 
 
 		 182 aa  288  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  75.28 
 
 		 182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  74.72 
 
 		 182 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  74.72 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  74.72 
 
 		 182 aa  278  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  74.16 
 
 		 182 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  73.03 
 
 		 182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  76.88 
 
 		 182 aa  269  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  73.03 
 
 		 182 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  72.47 
 
 		 182 aa  254  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  70.79 
 
 		 183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  64.44 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  73.68 
 
 		 127 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  41.62 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  43.01 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  46.89 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  42.47 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  52.03 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  40.96 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  38.79 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  57.29 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  39.77 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  36.93 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  36.88 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  40.49 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  46.02 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  44.92 
 
 		 220 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  41.75 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  43.75 
 
 		 212 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  43.75 
 
 		 212 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  44.07 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  46.88 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.49 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  41.24 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  75 
 
 		 44 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  27.35 
 
 		 224 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>