43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3877 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  348  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  44.71 
 
 
185 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  45.51 
 
 
186 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  38.64 
 
 
186 aa  134  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  40.35 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  39.66 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  38.79 
 
 
186 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  44.32 
 
 
185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  41.92 
 
 
183 aa  130  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  40.12 
 
 
182 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  39.51 
 
 
182 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  40.61 
 
 
182 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  39.51 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  40.61 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  39.88 
 
 
182 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  39.26 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  38.79 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  40.24 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  40.96 
 
 
182 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  39.39 
 
 
183 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  38.32 
 
 
181 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  37.93 
 
 
187 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  40.74 
 
 
182 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  40.74 
 
 
182 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  39.18 
 
 
195 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  35.8 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  46.79 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  46.79 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  48.42 
 
 
205 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  48.04 
 
 
220 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  49.04 
 
 
193 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  48 
 
 
220 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  45.1 
 
 
234 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  32.94 
 
 
213 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  33.53 
 
 
213 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  36.59 
 
 
179 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  47.06 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.09 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  28.05 
 
 
214 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  31.46 
 
 
221 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  24.36 
 
 
224 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>