36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3981 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  41.21 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  38.8 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  35.81 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  34.27 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  34.27 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  38.32 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  33.87 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  30.65 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  38.17 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  37.31 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  36.57 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  37.98 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  37.98 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  36 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  35.88 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  32.66 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  28.65 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  28.65 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  35.8 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  30.16 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  30.47 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  32.26 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  28.4 
 
 		 172 aa  48.5  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  35.42 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  29.06 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  31.58 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  30.48 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  30.61 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  29.81 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  31.73 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  26.32 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  31.25 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>