32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2146 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  100 
 
 		 345 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  100 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  90.78 
 
 		 217 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  86.92 
 
 		 214 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  85.98 
 
 		 214 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  67.44 
 
 		 224 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  66.82 
 
 		 224 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  68.4 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  51 
 
 		 236 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  47.29 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  43.16 
 
 		 226 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  35.87 
 
 		 221 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  39 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  46.61 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  27.4 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  33.96 
 
 		 214 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  33.06 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  37.5 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  31.93 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  31.58 
 
 		 227 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  34.88 
 
 		 181 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  33.72 
 
 		 181 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  31.48 
 
 		 195 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  28.07 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  28.1 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  32.26 
 
 		 183 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  29.81 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  30.69 
 
 		 185 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  27.71 
 
 		 187 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>