56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2750 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  58.77 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  58.25 
 
 
193 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  44.32 
 
 
194 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  56.73 
 
 
183 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  39.77 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  47.62 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  41.82 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  41.86 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  39.18 
 
 
172 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  55 
 
 
185 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  51.04 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  50.52 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  51.04 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  39.16 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  36.61 
 
 
186 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  38.51 
 
 
182 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  39.53 
 
 
182 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  37.93 
 
 
182 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  37.93 
 
 
182 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  37.14 
 
 
182 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  45.76 
 
 
213 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  48.04 
 
 
182 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  45.76 
 
 
213 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  47.42 
 
 
183 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  45.61 
 
 
182 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  42.31 
 
 
212 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  42.31 
 
 
212 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  49.5 
 
 
187 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  47.22 
 
 
193 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  45.54 
 
 
234 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  42.86 
 
 
220 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  42.2 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  43.75 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  45.45 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  40 
 
 
179 aa  89  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  40.4 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  37.11 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  36.14 
 
 
232 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  30.58 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  28.93 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  52.27 
 
 
127 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  32.74 
 
 
236 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  34.82 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  30.83 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  31.13 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  31.48 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  35.85 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  31.13 
 
 
345 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  30.56 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  27.78 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  33.01 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  29.15 
 
 
219 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  31.68 
 
 
204 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.912251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>