54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4764 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  65.83 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  57.14 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  57.14 
 
 		 220 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  56.48 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  57.53 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  52.97 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  48.12 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  53.51 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  33.16 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  42.31 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  35.23 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  46.88 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  47.52 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  39.52 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  43.64 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  46.79 
 
 		 172 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  37.59 
 
 		 194 aa  98.6  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  40.62 
 
 		 181 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  40.68 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  35.08 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  43.75 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  40.98 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  44.9 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  44.9 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  44.9 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  40.98 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  44.9 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  42.11 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  40.94 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  38.28 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  43.88 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  40.59 
 
 		 179 aa  92.8  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  42.45 
 
 		 186 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  48.11 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  45.63 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  43.81 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  34.55 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  32.73 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  34.74 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  33.02 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  34.23 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  29.45 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  32.08 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  30 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  27.78 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  29.57 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  35.11 
 
 		 226 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  38.64 
 
 		 127 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  30.39 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  29.67 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  26.92 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>