50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4076 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  98.12 
 
 		 213 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  58.45 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  57.64 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  58.73 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  56.84 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  56.84 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  57.22 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  39.66 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  42.78 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  41.44 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  36.93 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  50.52 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  45.45 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  47.96 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  46 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  37.71 
 
 		 182 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  46.85 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  37.14 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  37.71 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  37.14 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  38.29 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  37.5 
 
 		 186 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  36.99 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  43.09 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  35.88 
 
 		 181 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  37.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  36.72 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  39.05 
 
 		 185 aa  92  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  40.83 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  43.24 
 
 		 181 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  39.34 
 
 		 179 aa  88.2  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  34.12 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  45.54 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  37.43 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  38.79 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  31.73 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  37.5 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  31.07 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  33.04 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  57.89 
 
 		 44 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  26.67 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  31.63 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  34.41 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  30.61 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>