42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0348 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  99.45 
 
 		 182 aa  351  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  96.7 
 
 		 182 aa  345  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  90.66 
 
 		 182 aa  328  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  91.21 
 
 		 182 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  91.21 
 
 		 182 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  90.66 
 
 		 182 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  90.66 
 
 		 182 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  73.63 
 
 		 182 aa  283  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  72.47 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  74.73 
 
 		 182 aa  269  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  71.82 
 
 		 183 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  69.78 
 
 		 182 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  98.33 
 
 		 127 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  67.23 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  42.31 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  43.33 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  45.16 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  43.5 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  51.18 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  41.9 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  55.67 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  40.74 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  36.93 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  38.29 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  51.55 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  51.04 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  51.04 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  37.14 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  37.14 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  51.04 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  40.99 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  39.69 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  45.83 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  42.11 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  42.11 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  45.63 
 
 		 144 aa  89.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  46.88 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  95.45 
 
 		 44 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.37 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  24.72 
 
 		 224 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>