38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0342 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  245  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  98.33 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  98.33 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  95.83 
 
 		 182 aa  225  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  89.08 
 
 		 182 aa  210  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  88.33 
 
 		 182 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  89.08 
 
 		 182 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  88.24 
 
 		 182 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  88.24 
 
 		 182 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  74.17 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  73.68 
 
 		 186 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  77.31 
 
 		 182 aa  176  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  72.27 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  68.07 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  66.96 
 
 		 182 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  42.74 
 
 		 186 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  39.52 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  40.62 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  37.8 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  39.17 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  46.67 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  31.25 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  31.45 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  39.81 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  52.27 
 
 		 185 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  52.27 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  52.27 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  47.73 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.4 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  43.48 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  45.45 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  45.45 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  43.18 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  34.21 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  38.64 
 
 		 212 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  38.64 
 
 		 212 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>