43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2101 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  54.4 
 
 		 186 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  41.62 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  42.31 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  40.64 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  42.31 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  41.76 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  41.76 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  40.22 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  37.7 
 
 		 194 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  41.21 
 
 		 182 aa  138  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  40.54 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  42.31 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  42.31 
 
 		 182 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  38.8 
 
 		 182 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  53.27 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  40.11 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  39.67 
 
 		 182 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  38.64 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  42.11 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  38.12 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  48.6 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  36.61 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  38.18 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  37.08 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  37.3 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  35.76 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  37.79 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  36.11 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  42.98 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  44.83 
 
 		 144 aa  90.5  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  35.36 
 
 		 220 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  44.44 
 
 		 234 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  42.74 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.46 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  31.31 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  29.29 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  29.87 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>