47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2175 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  100 
 
 		 181 aa  357  6e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  60.89 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  36.11 
 
 		 213 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  31.46 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  31.49 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  32.02 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  37.43 
 
 		 213 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  36.26 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  31.46 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  31.46 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  37.98 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  41.84 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  35.82 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  37.6 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  36.67 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  29.47 
 
 		 220 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  29.51 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  33.14 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  31.61 
 
 		 181 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  30.32 
 
 		 205 aa  84.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  31.46 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  36.75 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  38.68 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  37.11 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  32.12 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  42.27 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  37.04 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  36.7 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  35.9 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  29.76 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  29.76 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  30.68 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  32.5 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  26.67 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  31.25 
 
 		 214 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  29.73 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  24.69 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>