46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3061 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  90.45 
 
 		 220 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  71.36 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  55.88 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  58.73 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  58.73 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  39.77 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  47.9 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  49.5 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  51.04 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  46.09 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  51.04 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  40.27 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  51.04 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  44.54 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  43.33 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  43.7 
 
 		 183 aa  98.6  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  44.92 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  37.58 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  42.61 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  48.04 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  36.11 
 
 		 186 aa  92  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  45.92 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  38.58 
 
 		 181 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  38.24 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  44.12 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  42.02 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.47 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  32.29 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  30.21 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  31.73 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  33.01 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0339  hypothetical protein  58.33 
 
 		 44 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  27.5 
 
 		 221 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>