32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0481 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  100 
 
 		 204 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  34.33 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  37.5 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  35.71 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  34.51 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  35.54 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  35.83 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  29.92 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  33.93 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  36.42 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  28.68 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  39.82 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  34.55 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  30.65 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  34.32 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  33.33 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1992  ketosynthase  27.16 
 
 		 246 aa  48.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  32.12 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  31.78 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  31.78 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2069  hypothetical protein  28.26 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  31.2 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  33.02 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  33.02 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  28.97 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  37.14 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  33.85 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  30.16 
 
 		 181 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  29.7 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  33.65 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>