16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2069 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2069  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  483  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1992  ketosynthase  97.97 
 
 		 246 aa  425  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  61.23 
 
 		 227 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  28.26 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  26.77 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  26.77 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  26.77 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  25.98 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  25.2 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  27.56 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  25.78 
 
 		 214 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  25.2 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  28.02 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  26.61 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  28.21 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>