25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2670 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  100 
 
 		 214 aa  423  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  46.97 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  37.5 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  39.67 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  36.15 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  31.16 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  29.67 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  33.06 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  30.95 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  30.39 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  34.19 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  30.34 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  30.71 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  30.4 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  31.15 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  31.15 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  29.44 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  30.41 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  28.65 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  31.01 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  32.65 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  29.23 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>