97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2165 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  84.65 
 
 		 215 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  84.19 
 
 		 215 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  71.56 
 
 		 222 aa  315  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  70.83 
 
 		 216 aa  305  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  64.02 
 
 		 219 aa  277  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  61.21 
 
 		 215 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 		 215 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 		 215 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 		 215 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 		 215 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 		 215 aa  266  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  59.53 
 
 		 215 aa  265  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  60.93 
 
 		 214 aa  264  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.88 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.81 
 
 		 215 aa  261  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.07 
 
 		 215 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.35 
 
 		 215 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.35 
 
 		 215 aa  261  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.88 
 
 		 215 aa  261  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.88 
 
 		 215 aa  260  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.81 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.07 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  58.8 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.74 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.74 
 
 		 215 aa  250  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.74 
 
 		 215 aa  250  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 		 215 aa  248  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  53.02 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.08 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  53.99 
 
 		 206 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  55.56 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.37 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  53.7 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.8 
 
 		 213 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.33 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48 
 
 		 203 aa  214  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  49.56 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.23 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.26 
 
 		 202 aa  204  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.5 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.66 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.13 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  47.29 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.05 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.05 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.86 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.79 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.58 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.86 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  40.19 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.34 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.86 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.53 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.76 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.6 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.91 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.23 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.23 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  44.95 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  37.95 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  38.71 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  39.15 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.75 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.57 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  43.72 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  43.93 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  40.59 
 
 		 232 aa  121  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  35.14 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  30.62 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  44.83 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.12 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.76 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  33.14 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  30.5 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  28.77 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  29.41 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  32.57 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  35 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.01 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.63 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30.39 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.67 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.61 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  26.09 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.71 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.05 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  23.33 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.78 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  22.54 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  25 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1189  putative pyroglutamyl-peptidase  24.43 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.389859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4016  hypothetical protein  21.18 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>