82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0297 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  94.15 
 
 		 205 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  81.77 
 
 		 213 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  57.14 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  38.43 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  45.2 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.54 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  39.23 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  36.02 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  38.83 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  36.76 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  41.57 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  39.29 
 
 		 225 aa  85.1  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  33.19 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  32.77 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.82 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.88 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.25 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.99 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  34.88 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.54 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.86 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.86 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.97 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.78 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.38 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  30.57 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.32 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.21 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.21 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  31.87 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  29.55 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  31.49 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  29.38 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.8 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.98 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.98 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.35 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.98 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.49 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.73 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.29 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  32.42 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.77 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.06 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.12 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.63 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.49 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.49 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.49 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.94 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.49 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  24.76 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.97 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.05 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.99 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.99 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.99 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.99 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.42 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  28.49 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.26 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.42 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.42 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.96 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.23 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  26.37 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.57 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  25.88 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.25 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  23.46 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  30.81 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.26 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.4 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.86 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.57 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  25.25 
 
 		 252 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.42 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.6 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  31.95 
 
 		 223 aa  42  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.71 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>