47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1074 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  100 
 
 		 286 aa  553  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  36.24 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  35.1 
 
 		 224 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  46.43 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.67 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  33.19 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  48.45 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  43 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  46.39 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  29.96 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.6 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  41.58 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.4 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.17 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.87 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.55 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  44.23 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24 
 
 		 202 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  29.91 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.89 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.05 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  26.13 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  25.64 
 
 		 214 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.36 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.78 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.68 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.75 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  26.43 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.51 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.23 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  27.56 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.35 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.11 
 
 		 215 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  21.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.2 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.2 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.63 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  23.43 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.41 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.39 
 
 		 200 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  21.77 
 
 		 217 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.89 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.86 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.89 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.89 
 
 		 215 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>