97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0871 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  67.44 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  66.51 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  65.44 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  63.08 
 
 		 216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  62.15 
 
 		 215 aa  264  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.81 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  58.41 
 
 		 215 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  58.41 
 
 		 215 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  56.54 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.54 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.54 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 		 214 aa  248  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.95 
 
 		 215 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.34 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50 
 
 		 215 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.16 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.16 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.16 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.07 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.93 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.66 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.66 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.66 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.66 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.66 
 
 		 215 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.73 
 
 		 215 aa  224  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.73 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.73 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.73 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.77 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.53 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  50.67 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  51.85 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  51.39 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.71 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.77 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  50.23 
 
 		 213 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.22 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.09 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.86 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.12 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.65 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.93 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.03 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.54 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.56 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.07 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.35 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  51.46 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.07 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.89 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.99 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.99 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  40.2 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.41 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.51 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  41.12 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  35.05 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  37.5 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  40.74 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.21 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.53 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  43.98 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.87 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  41.54 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.32 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.88 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  40.81 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  31.37 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  29.41 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.97 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  41.51 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.03 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.79 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  35.71 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  32.6 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.87 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  27.86 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.35 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.55 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.96 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.65 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.41 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.39 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.47 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.95 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.51 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.56 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.74 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.27 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  25 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1189  putative pyroglutamyl-peptidase  26.14 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.389859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  34.65 
 
 		 386 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>