90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1413 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  98.59 
 
 
213 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  62.91 
 
 
215 aa  284  7e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  64.02 
 
 
214 aa  265  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.46 
 
 
233 aa  259  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.6 
 
 
217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.8 
 
 
202 aa  258  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  60.1 
 
 
203 aa  254  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.72 
 
 
215 aa  254  9e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.5 
 
 
215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.08 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.08 
 
 
215 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.08 
 
 
215 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.08 
 
 
215 aa  238  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.86 
 
 
215 aa  238  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.86 
 
 
215 aa  238  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.29 
 
 
215 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.08 
 
 
215 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.03 
 
 
214 aa  234  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.13 
 
 
215 aa  234  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.03 
 
 
215 aa  232  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.7 
 
 
215 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.76 
 
 
214 aa  228  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.34 
 
 
215 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.53 
 
 
215 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.85 
 
 
215 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.53 
 
 
215 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.17 
 
 
212 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.17 
 
 
212 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  54.08 
 
 
207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.85 
 
 
215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.33 
 
 
215 aa  221  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.06 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.64 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.76 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.67 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.03 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.19 
 
 
219 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.89 
 
 
212 aa  210  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.83 
 
 
212 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.26 
 
 
222 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50 
 
 
212 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  45.45 
 
 
213 aa  205  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  45.75 
 
 
206 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  46.01 
 
 
217 aa  204  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.19 
 
 
216 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  48.34 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  42.2 
 
 
214 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.92 
 
 
222 aa  188  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  41.44 
 
 
224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.56 
 
 
222 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.43 
 
 
212 aa  181  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  37.91 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  43.43 
 
 
201 aa  176  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.86 
 
 
215 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.86 
 
 
215 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.09 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  37.38 
 
 
214 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.09 
 
 
226 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.54 
 
 
211 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.92 
 
 
208 aa  145  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.91 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  38.92 
 
 
208 aa  141  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.47 
 
 
231 aa  141  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  41.52 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  34.01 
 
 
205 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.39 
 
 
222 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.76 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  35.68 
 
 
223 aa  132  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  37.62 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  35.14 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  33.97 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  34.72 
 
 
215 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.86 
 
 
211 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.33 
 
 
225 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  39.42 
 
 
146 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.09 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.29 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  24.74 
 
 
167 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30.48 
 
 
128 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  24.71 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  20.93 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.58 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  22.81 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  22.41 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.29 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  21.59 
 
 
286 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  23.08 
 
 
216 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  21.97 
 
 
171 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  22.54 
 
 
171 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>