96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1120 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  99.53 
 
 
215 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  99.07 
 
 
215 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  77.67 
 
 
214 aa  355  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  65.12 
 
 
214 aa  305  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  60.47 
 
 
215 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  60.47 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.95 
 
 
215 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.81 
 
 
215 aa  270  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 
215 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 
215 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 
215 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 
215 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.49 
 
 
215 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.49 
 
 
215 aa  266  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.02 
 
 
215 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.95 
 
 
215 aa  263  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  58.22 
 
 
219 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.56 
 
 
215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.34 
 
 
222 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.35 
 
 
215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  56.13 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.56 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.88 
 
 
215 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.42 
 
 
215 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50 
 
 
215 aa  241  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  51.63 
 
 
215 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.16 
 
 
215 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.16 
 
 
215 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.25 
 
 
215 aa  232  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  52.83 
 
 
206 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.7 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.16 
 
 
222 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.67 
 
 
214 aa  225  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  52.09 
 
 
213 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47 
 
 
217 aa  223  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.7 
 
 
222 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.78 
 
 
203 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  47.53 
 
 
224 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.53 
 
 
213 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.06 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  47.55 
 
 
207 aa  207  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.91 
 
 
214 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.39 
 
 
216 aa  205  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50 
 
 
215 aa  204  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.84 
 
 
212 aa  204  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.96 
 
 
202 aa  201  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48 
 
 
212 aa  201  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.73 
 
 
212 aa  201  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  45.87 
 
 
214 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.24 
 
 
233 aa  198  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.45 
 
 
215 aa  194  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.67 
 
 
212 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.67 
 
 
212 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  41.12 
 
 
213 aa  182  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.45 
 
 
226 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.37 
 
 
212 aa  174  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  44.61 
 
 
208 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  42.13 
 
 
201 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  40 
 
 
214 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  43.72 
 
 
209 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.1 
 
 
211 aa  161  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.62 
 
 
200 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  45.33 
 
 
223 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.71 
 
 
208 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.75 
 
 
205 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.83 
 
 
231 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.44 
 
 
222 aa  151  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44 
 
 
203 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  39.36 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.81 
 
 
211 aa  131  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  34.67 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  36.45 
 
 
215 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  37.37 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.98 
 
 
225 aa  105  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  43.27 
 
 
146 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.36 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.03 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.59 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  29.07 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.25 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.46 
 
 
128 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  26.02 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25 
 
 
171 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.14 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  24.49 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  23.89 
 
 
171 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.49 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  24.77 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.84 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.13 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  23.84 
 
 
167 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1189  putative pyroglutamyl-peptidase  31.39 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.389859  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  23.89 
 
 
286 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>