87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1921 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  87.98 
 
 		 219 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  76.78 
 
 		 216 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  71.15 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  67.92 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  62.86 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  66.99 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  37.27 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  39.23 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  37.22 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  39.13 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  37.16 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  39.56 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.46 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.11 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  46.39 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.14 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.9 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  25.58 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  29.57 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.77 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.41 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  28.49 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.71 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  28.18 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.75 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  22.46 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.74 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  29.38 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.28 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.11 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  29.21 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.14 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.09 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.61 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.09 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  26.26 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.49 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.49 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.7 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  28.49 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.7 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.4 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.65 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.16 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.4 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.53 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.01 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03943  pyroglutamyl peptidase type I, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08155)  27.56 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.48 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.2 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.74 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.44 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.27 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.39 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.55 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  20.99 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.18 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  28.19 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  20.99 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  20.99 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  21.55 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.5 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  20.99 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.19 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  20.99 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  21.55 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.56 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.91 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.41 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.88 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.84 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  29.31 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.87 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  30.73 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.41 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.86 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.65 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  25 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  22.81 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.88 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  21.02 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  26.92 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.39 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.95 
 
 		 219 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  28.04 
 
 		 232 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.63 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>