86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0373 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  81.77 
 
 
205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  80.3 
 
 
205 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  55.77 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  37.27 
 
 
215 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  39.05 
 
 
219 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  37.62 
 
 
219 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.29 
 
 
218 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  41.1 
 
 
224 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  38.5 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  35.41 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  35.68 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  40.22 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.77 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.96 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.78 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  33.52 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.71 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.03 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.87 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.46 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.43 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  29.77 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.77 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.17 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  30.22 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.32 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  32.08 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.86 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.78 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.86 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.85 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.77 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.57 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.87 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  31.58 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.7 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.37 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  31.03 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.16 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.25 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.49 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.25 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.25 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.91 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.93 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.71 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.99 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.7 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.37 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.37 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.37 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  28.65 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  27.43 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.27 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  30 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  31.98 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.68 
 
 
215 aa  54.7  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  27.66 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.19 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.82 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.7 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.82 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.49 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.49 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.52 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.53 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.03 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  24.56 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.28 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.09 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.64 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.09 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.19 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.61 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.57 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.57 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.14 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  26.97 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  32.49 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  29.38 
 
 
214 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  27.32 
 
 
252 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.34 
 
 
231 aa  45.1  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.47 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.73 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.7 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>