83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2317 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  61.79 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  61.79 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.53 
 
 		 215 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.02 
 
 		 215 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.97 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.02 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.74 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.47 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.33 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.97 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  47.37 
 
 		 217 aa  185  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.7 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  45.97 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.67 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 215 aa  177  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.79 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.79 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.79 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.6 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.31 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.37 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.37 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.45 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.37 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.31 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.15 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.64 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.13 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.34 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.79 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.1 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.63 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.56 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.38 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.8 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  42.86 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.21 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  41.03 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.91 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.05 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  38.73 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.4 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.97 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.97 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  39.9 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.21 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  36.77 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.62 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  36.92 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  36.87 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.96 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  38.76 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.57 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.06 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  37.21 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.83 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  35.71 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.67 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.8 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.82 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  35.86 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  32.84 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.84 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  32.21 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.5 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  35.66 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  29.9 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  37.25 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  21.96 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30.3 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.71 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.59 
 
 		 128 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.26 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.57 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.7 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  24.02 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>