96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1260 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  78.14 
 
 
215 aa  358  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  78.14 
 
 
215 aa  357  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  77.67 
 
 
215 aa  355  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  70.09 
 
 
214 aa  324  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  63.72 
 
 
215 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.53 
 
 
215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  64.65 
 
 
215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  58.14 
 
 
215 aa  278  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.21 
 
 
215 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.07 
 
 
215 aa  275  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.36 
 
 
222 aa  274  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.67 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.67 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.67 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.67 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.67 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  60.75 
 
 
219 aa  272  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.21 
 
 
215 aa  270  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.74 
 
 
215 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  57.82 
 
 
217 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.94 
 
 
216 aa  262  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.67 
 
 
215 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.67 
 
 
215 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.07 
 
 
215 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.6 
 
 
215 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 
215 aa  248  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.28 
 
 
222 aa  248  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  56.6 
 
 
206 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  52.56 
 
 
215 aa  244  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.02 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.02 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.6 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  54.67 
 
 
213 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.4 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.02 
 
 
222 aa  231  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.11 
 
 
214 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.84 
 
 
203 aa  228  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.5 
 
 
213 aa  226  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.03 
 
 
213 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  48.88 
 
 
224 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.7 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.22 
 
 
212 aa  218  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  50.49 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.07 
 
 
214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  47.93 
 
 
214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.44 
 
 
216 aa  209  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.34 
 
 
212 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50 
 
 
212 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.51 
 
 
202 aa  205  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.45 
 
 
233 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.58 
 
 
215 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  44.81 
 
 
213 aa  185  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.23 
 
 
212 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.23 
 
 
212 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  42.33 
 
 
214 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.02 
 
 
226 aa  175  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  46.12 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.51 
 
 
211 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  41.12 
 
 
201 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.26 
 
 
231 aa  166  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.38 
 
 
212 aa  165  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.64 
 
 
200 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.34 
 
 
203 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  44.6 
 
 
223 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.31 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.81 
 
 
208 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.72 
 
 
205 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  44.12 
 
 
208 aa  151  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  42.33 
 
 
215 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.29 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  37.97 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  35.68 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  40 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.91 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  41.94 
 
 
146 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.72 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  33.33 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  33.71 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  36 
 
 
128 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.03 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  32.22 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  28.88 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  26.23 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.67 
 
 
171 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.68 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.67 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  27.27 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.14 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.49 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.98 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.59 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.41 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  26.26 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  24.05 
 
 
286 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1189  putative pyroglutamyl-peptidase  28.57 
 
 
174 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.389859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>