40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43368 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.29 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.76 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03943  pyroglutamyl peptidase type I, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08155)  23.45 
 
 
283 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.77 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.77 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.26 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.77 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.44 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.87 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  26.4 
 
 
215 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.57 
 
 
214 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.15 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.14 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  28.57 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.92 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  24.24 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.44 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  26.6 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  24.37 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  26.7 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.23 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  30.81 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.84 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  24.77 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.86 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.57 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.32 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.25 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  22.34 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  25 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  27.14 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.89 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.93 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  25 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>