89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0885 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.17 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.33 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.5 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.54 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.16 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.07 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.93 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  40.83 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.93 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.67 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.67 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.58 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  40.19 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.25 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.25 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.45 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.68 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.75 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.16 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.83 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.96 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.69 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.57 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.24 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.11 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.11 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.97 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.35 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.11 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.11 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.11 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.3 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.65 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.92 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.11 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.19 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.68 
 
 		 231 aa  127  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.45 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.45 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  37.44 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.45 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.19 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.05 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.14 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.27 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  39.15 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.82 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  37.56 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  38.36 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  39.71 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.16 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  34.15 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.99 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.92 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  43.6 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  38.71 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  35.86 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.19 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  34.72 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  33.33 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.96 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.96 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  28.78 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.78 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.83 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.33 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  32.24 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  31.16 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  29.13 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  37.62 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  33.68 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  31.82 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.9 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.03 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  35.59 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  29.78 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.31 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.98 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  29.21 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30.81 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.61 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  30.18 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.04 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  30.81 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.98 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  27.38 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30 
 
 		 128 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>