75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3440 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  100 
 
 
146 aa  294  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.35 
 
 
222 aa  153  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.65 
 
 
215 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.6 
 
 
215 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.15 
 
 
215 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.38 
 
 
219 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.28 
 
 
215 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.83 
 
 
215 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.6 
 
 
215 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.12 
 
 
215 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.12 
 
 
215 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.12 
 
 
215 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.12 
 
 
215 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.71 
 
 
222 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.12 
 
 
215 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.36 
 
 
214 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.19 
 
 
215 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.19 
 
 
215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.15 
 
 
215 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.15 
 
 
215 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.69 
 
 
215 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.66 
 
 
215 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.94 
 
 
214 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.95 
 
 
216 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 
215 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 
215 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 
215 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.6 
 
 
215 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  45.19 
 
 
215 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.18 
 
 
203 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.75 
 
 
215 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.58 
 
 
217 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.74 
 
 
208 aa  88.6  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  40 
 
 
217 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.27 
 
 
222 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.75 
 
 
212 aa  87.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.74 
 
 
212 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.69 
 
 
215 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.42 
 
 
213 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.42 
 
 
213 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.02 
 
 
215 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  37.1 
 
 
206 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.78 
 
 
212 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  40.95 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.24 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.76 
 
 
215 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.86 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  36.44 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.03 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  40.32 
 
 
213 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.51 
 
 
222 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.17 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.05 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  44.34 
 
 
232 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.1 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.46 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.58 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.71 
 
 
215 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  41.94 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  32.84 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.25 
 
 
212 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.7 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.29 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.84 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  27.78 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.76 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.76 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.62 
 
 
225 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  26.15 
 
 
211 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  35.59 
 
 
215 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44 
 
 
211 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  34.88 
 
 
214 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  37.78 
 
 
209 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  30.16 
 
 
208 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  23.77 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>