95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2740 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.41 
 
 
215 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.41 
 
 
215 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.64 
 
 
214 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.62 
 
 
215 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  43.72 
 
 
215 aa  161  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.62 
 
 
215 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.62 
 
 
215 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.62 
 
 
214 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.9 
 
 
215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.97 
 
 
222 aa  158  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.91 
 
 
215 aa  157  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.82 
 
 
219 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.71 
 
 
215 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.89 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.62 
 
 
215 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.62 
 
 
215 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.4 
 
 
215 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.11 
 
 
216 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.41 
 
 
222 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.38 
 
 
215 aa  151  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.16 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.22 
 
 
215 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.02 
 
 
211 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  40.72 
 
 
217 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.61 
 
 
231 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.56 
 
 
215 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.15 
 
 
212 aa  147  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.1 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.56 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.54 
 
 
214 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.88 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.46 
 
 
216 aa  143  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.92 
 
 
213 aa  141  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.53 
 
 
222 aa  141  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  43.43 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.91 
 
 
213 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  39.11 
 
 
213 aa  137  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.76 
 
 
203 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.51 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  35.18 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.13 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.87 
 
 
233 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.25 
 
 
215 aa  132  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.53 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  40.59 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.156659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  36.68 
 
 
211 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  37.25 
 
 
206 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  36.06 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.96 
 
 
222 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.67 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.43 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  37.57 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  38.17 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  38.97 
 
 
215 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  34.85 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.92 
 
 
226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  34.85 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.14 
 
 
208 aa  118  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  31.98 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  38.27 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  37.95 
 
 
211 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  36.87 
 
 
223 aa  99.4  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  32.57 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  27.37 
 
 
225 aa  84.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  42.86 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30.46 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  30.41 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.14 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  28.24 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  29.35 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.87 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.73 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  33.71 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  25.25 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.06 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30.06 
 
 
205 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  27.43 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4016  hypothetical protein  25.44 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  32.32 
 
 
128 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  30.06 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.15 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.47 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  24.39 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>