91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0340 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.86 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.44 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.03 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  47.93 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.03 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.98 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.39 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.54 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.39 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.39 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.57 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.85 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.23 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.78 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.75 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.86 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.78 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.76 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.32 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.32 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.32 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.75 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.99 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.57 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.27 
 
 		 215 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.63 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.86 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.65 
 
 		 233 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.5 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  45.85 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  45.41 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.86 
 
 		 215 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.86 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.73 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.4 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.94 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  45.62 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.78 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.67 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.67 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.22 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.75 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.69 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  41.47 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  45.41 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.35 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.35 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.54 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.1 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  39.35 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  40.91 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  39.41 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.58 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.43 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.44 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  43.96 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  36.41 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.54 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.46 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.61 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.12 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  37.56 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.64 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  36.95 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  35.29 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  41.67 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  36.45 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  40.3 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  34.15 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  36.84 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  33.02 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  34.69 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.61 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  38.1 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  25.38 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.57 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  24.87 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.57 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.44 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.87 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.09 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  24.59 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.84 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.65 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  23.96 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  26.26 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25.28 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>